从20世纪初开始在世界各地突然出现个性丰富的怪兽们。
起初人类试图抵抗，但在巨大的力量面前不可能做到完全驱逐。人们决定把智慧集中在监视、分析怪兽上，于是诞生了“国连怪兽监视团”。
以不屈不挠的领导者海堂勇一郎事务局局长为首，怪兽生态学的权威小林丸兆治，怪兽功能分析学的才子克莱尔·科尔曼，怪兽防灾学的异端者肯尼御子柴，对怪兽战略学的贵公子尼基塔·塔尔科夫斯基，开拓怪兽语言学之路的新世代露露·杜·皮卡德，还有怪兽生命科学的泰斗吉列尔莫·马尔克斯。
怪兽科学专家们监视分析了数百只怪兽，继续探索怪兽和人类共同生存的世界。

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